Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SkiQ60698 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms