Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms