Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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