Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp48Q3V0C5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp48Q3V0C5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Usp48Q3V0C5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Usp48Q3V0C5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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