Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Snx27Q3UHD6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Snx27Q3UHD6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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