Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf180Q3U827 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms