Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccndbp1Q3TVC7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccndbp1Q3TVC7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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