Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms