Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Spatc1Q148B6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Spatc1Q148B6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spatc1Q148B6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spatc1Q148B6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spatc1Q148B6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Spatc1Q148B6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Spatc1Q148B6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Spatc1Q148B6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spatc1Q148B6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms