Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms