Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms