Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms