Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms