Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aplp2Q06335 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms