Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms