Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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