Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms