Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms