Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms