Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gabpb1Q00420 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gabpb1Q00420 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gabpb1Q00420 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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