Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Flt3Q00342 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Flt3Q00342 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms