Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms