Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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