Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms