Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms