Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ClgnP52194 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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