Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms