Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx3P50481 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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