Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms