Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms