Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms