Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn11P35235 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms