Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms