Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pola2P33611 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms