Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms