Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms