Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms