Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms