Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TP20293 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TP20293 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TP20293 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TP20293 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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