Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18533 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18533 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18533 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18533 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms