Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms