Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms