Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms