Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem254bP0DN90 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms