Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnfP06804 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnfP06804 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnfP06804 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms