Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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