Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BckdkO55028 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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