Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sp100O35892 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Sp100O35892 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Sp100O35892 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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