Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms