Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms